แม้ว่าคอมพิวเตอร์อุตสาหกรรมและตัวควบคุมส่วนกลางจะคล้ายกันมาก แต่ก็ยังมีความแตกต่างบางประการ:
การใช้งานที่แตกต่างกัน: คอมพิวเตอร์ควบคุมทางอุตสาหกรรมมักจะใช้สำหรับการควบคุมอัตโนมัติและการได้มาและการประมวลผลข้อมูลในระบบควบคุมอุตสาหกรรม ตัวควบคุมส่วนกลางมักจะใช้สำหรับระบบควบคุมส่วนกลางของอาคารขนาดใหญ่หรือบ้านอัจฉริยะที่รับผิดชอบในการควบคุมการทำงานของอุปกรณ์หรือระบบทั้งหมด
ความสามารถในการประมวลผลที่แตกต่างกัน: เนื่องจากความจำเป็นในการประมวลผลข้อมูลแบบเรียลไทม์ คอมพิวเตอร์ควบคุมทางอุตสาหกรรมจึงต้องมีความสามารถในการประมวลผลที่สูงขึ้นและความเร็วในการตอบสนองที่เร็วขึ้น อย่างไรก็ตาม ตัวควบคุมส่วนกลางมักจะไม่จำเป็นต้องประมวลผลข้อมูลจำนวนมากและการควบคุมแบบเรียลไทม์ และความสามารถในการประมวลผลก็ค่อนข้างต่ำ
ความสามารถในการขยายที่แตกต่างกัน: คอมพิวเตอร์ควบคุมทางอุตสาหกรรมมักจะมีความสามารถในการขยายที่แข็งแกร่งกว่า และสามารถเพิ่มสล็อต อินเทอร์เฟซ และโมดูลเพิ่มเติมได้ตามต้องการ ตัวควบคุมส่วนกลางมักจะค่อนข้างคงที่ มีความสามารถในการขยายขนาดได้น้อย และแทบไม่มีโอกาสได้รับการอัปเกรด
สภาพแวดล้อมการทำงานที่แตกต่างกัน: โดยทั่วไปแล้วคอมพิวเตอร์อุตสาหกรรมจะใช้ในสภาพแวดล้อมทางอุตสาหกรรมที่รุนแรงซึ่งต้องการความทนทานและความน่าเชื่อถือที่สูงกว่า ในขณะที่ตัวควบคุมส่วนกลางมักใช้ในสภาพแวดล้อมที่มั่นคง เช่น บ้านหรือสำนักงาน
การกำหนดค่าฮาร์ดแวร์ที่แตกต่างกัน: คอมพิวเตอร์ควบคุมทางอุตสาหกรรมมักจะมีข้อกำหนดการกำหนดค่าฮาร์ดแวร์ที่เข้มงวดกว่า โดยต้องการคุณสมบัติต่างๆ เช่น ความต้านทานการรบกวนทางแม่เหล็กไฟฟ้า การป้องกันฝุ่น การกันน้ำ และการทนต่อแรงกระแทก อย่างไรก็ตาม ตัวควบคุมส่วนกลางมักจะไม่ต้องการคุณสมบัติเหล่านี้